银杏苗圃病害主要有根腐并茎腐并叶枯玻虫害主要是地老虎、金龟子等。
1、银杏根腐病
病原菌为镰刀菌。病菌从根部侵入，一般在6月份发生。使根部腐烂脱皮，木质部呈黑褐色，叶片逐渐萎蔫、干枯。排水不良、苗木过密的阴湿圃地发生率较高。其防治方法是①及时拔掉病株烧毁；②发病期用70%托布津1000倍液喷雾；③及时排除积水，搞好间苗。
2、银杏茎腐病
病菌易侵入苗茎，有两种情况：①幼苗出土后苗木木质化程度低。尤其在无遮阴措施，不能及时浇水降低地表温度的情况下，更易感染。病菌侵入苗茎后，发生褐色斑点，病斑逐渐扩大，引起茎部腐烂，呈猝倒状。一般发生在6月上旬。其防治方法一是及时浇水；二是连喷3次800倍多菌灵进行防治。②7月份左右，连续降雨和持续高温，使苗木茎部灼伤，苗木茎部变褐色，内皮层组织腐烂，逐渐扩展致根部，叶片逐渐死亡下垂。低洼易积水的苗圃地较易发生。其防治方法一是高温天气要搭阴棚在苗木行间覆草降低土壤温度，有条件的及时灌溉。阴雨天要注意排水，二是发病期间喷1%硫酸亚铁溶液，控制蔓延，三是防止人为碰伤苗木。
3、银杏叶枯病
黄色部位逐渐变褐坏死，病害初期叶先端变黄。逐步扩展为整个叶片变为褐色脱落。一般苗木生长过密、通风不良的苗圃地发生较严重。其防治方法是发病时喷多菌灵800倍液。
4、银杏虫害防治
①土壤。对钙质土壤每667㎡用过筛的农用硫酸亚铁细粉15㎏或喷洒多菌灵和2.5%敌百虫粉2.53㎏。对非钙质土用过筛的熟石炭粉15㎏进行；
②堆青草拌敌敌畏等药液诱杀害虫。
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